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PCR法
ゲノムDNAから目的遺伝子を単離し、増幅するための方法として①PCR法（ポリメラーゼ連鎖反応）が知られている。PCR法は多段階のステップからなる。
Ⅰ 反応溶液を約②９５℃まで加熱させて、③DNA二本鎖を解離させ、一本鎖にする。
Ⅱ ④５０～６０℃まで冷やしていくと、⑤プライマー（DNA）が一本鎖DNAと結合する。
Ⅲ 約７２℃まで温度を上げると、プライマーの部分を起点にして⑥耐熱性DNAポリメラーゼがDNAの合成を開始する。
Ⅳ これらのステップを繰り返すことで、目的遺伝子の配列が単離・増幅できる。
PCR法のプライマー選択
DNAポリメラーゼは、完全な一本鎖DNAからDNAを伸長させることが出来ず、局所的に①二本鎖となったところからDNAの合成を始める。それゆえ、DNAポリメラーゼを用いたDNA合成には②プライマーが必要である。生体内で用いられるプライマーは③RNAであるが、③RNAは化学的に不安定であるので、PCR法では④DNAがプライマーとして用いられる。PCR法で用いるプライマーは通常化学合成にて作製する。
PCR法では、通常２つのプライマーを用い、増幅したい領域を挟むように設計する。DNAポリメラーゼは⑤5’末端→3’末端の方向へしかDNAを伸長できないことを注意してプライマー配列を設定する。
（例題）
5’-ATGGTAGCCATGTCTGATTTAAACGTATGGCTGT-3’
3’-TACCATCGGTACAGACTAAATTTGCATACCGACA-5’
という二本鎖DNAの配列を増幅するため、8塩基のプライマーを設計したい。どのような配列のプライマーを設計すればいいか？
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